O museu está localizado na sede da FUMDHAM (Fundação Museu do Homem Americano), instituição responsável pela administração do museu e que iniciou os trabalhos e descobertas no Parque Nacional Serra da Capivara. A fundação foi criada a partir de uma colaboração entre cientistas brasileiros e franceses que atuam na região desde 1973.
O acervo do museu é composto por diversas peças encontradas ao longo de mais de 40 anos de pesquisas e trabalhos arqueológicos realizados no parque. Além das exposições, o museu dispõe de reservas técnicas que armazenam materiais arqueológicos, paleontológicos, zoológicos e botânicos, além de contar com laboratórios especializados.
Com a presença do museu e do Parque Nacional Serra da Capivara, a região se consolidou como um importante polo de conhecimento, promovendo o desenvolvimento de estudos sobre a história e a biodiversidade da região, além de contribuir para a formação de novos profissionais e para o avanço da arqueologia no Brasil.
